工程完工后，剩余的款项主要包括以下几部分：
质量保证金：
质量保证金是工程完工后必须留下的款项，用于在质保期内处理可能出现的质量问题。根据《建设工程价款结算暂行办法》，质量保证金一般占工程款的5%左右，在工程交付使用一年后进行清算，若质保期内有返修情况，发生费用应在保修金内扣除。
尾款：
尾款通常占工程款的2%-10%，具体比例根据合同约定。尾款的作用是约束乙方，要求其在工程中有需要修补的地方及时修补，并在一定时间内（通常为一年）无条件处理相关问题。尾款在工程验收合格后支付，但最长不超过一年。
保修卡：
有些情况下，尾款会作为保修卡发放，作为对承包人履行保修义务的保证。
综合以上信息，工程完工后一般支付到总金额的95%左右，剩下的5%作为质量保证金，尾款通常占2%-10%。具体比例和支付细节需根据工程合同中的约定执行。
建议：在签订工程合同时，应明确约定各项款项的支付比例、时间和方式，以避免后期纠纷。同时，承包人和发包人应严格按照合同约定履行各自义务，确保工程质量和进度。
