小叶紫檀的棕眼是指 树木在生长过程中吸收水分、养分的传输通道的横切面，即树干内筛管横切面所形成的孔眼。这些棕眼在木材中呈现出类似毛孔的小凹点，是天然形成的，其大小和形状在树木生长过程中就已经确定，不会因为盘玩过程而发生变化。
棕眼的存在对于小叶紫檀的密度和油性有很大影响。一般来说，棕眼越少且细，料质的密度越高，油性也越好，盘玩后能够形成非常美观的包浆。相反，棕眼越多且粗，则意味着料质结构较为疏松，油密度较差。
在鉴别小叶紫檀的真伪时，棕眼是一个重要的参考特征。真正的印度小叶紫檀在横切面上会有明显的棕眼，而非洲大叶紫檀则没有明显的棕眼或棕眼较少。通过观察棕眼的形态和数量，可以初步判断小叶紫檀的料质和真伪。
